123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3378 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  59.52 
 
 
737 aa  730    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2784  glucosyltransferase MdoH  84.46 
 
 
660 aa  1075    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  86.39 
 
 
656 aa  1100    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  73.01 
 
 
694 aa  925    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3378  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 
631 aa  1286    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  74.24 
 
 
671 aa  949    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  51.58 
 
 
717 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  48.74 
 
 
861 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  47.85 
 
 
860 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  48.38 
 
 
823 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  47.69 
 
 
852 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  48.02 
 
 
862 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  45.41 
 
 
847 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  45.41 
 
 
837 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  45.41 
 
 
847 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  45.41 
 
 
847 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  45.41 
 
 
847 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  45.41 
 
 
837 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  45.41 
 
 
847 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  45.87 
 
 
847 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  45.87 
 
 
847 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  45.87 
 
 
847 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  45.87 
 
 
847 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  45.87 
 
 
847 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  45.41 
 
 
837 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  46.02 
 
 
842 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  47.47 
 
 
849 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  47.63 
 
 
849 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  45.13 
 
 
832 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  44.33 
 
 
857 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  44.48 
 
 
857 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  45.09 
 
 
857 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  45.48 
 
 
856 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  44.17 
 
 
857 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  45.25 
 
 
861 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  45.33 
 
 
860 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  45.89 
 
 
854 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  48.91 
 
 
860 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  45.89 
 
 
854 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  45.23 
 
 
854 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  44.82 
 
 
853 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  45.23 
 
 
869 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  48.55 
 
 
859 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  45.54 
 
 
851 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  46.41 
 
 
845 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  49.91 
 
 
866 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  42.2 
 
 
715 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  40.85 
 
 
713 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  40.1 
 
 
698 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  38.58 
 
 
692 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  38.58 
 
 
692 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  39.59 
 
 
704 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  37.93 
 
 
679 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1668  glucosyltransferase MdoH  39.17 
 
 
701 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2578  glucosyltransferase MdoH  42 
 
 
716 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  36.46 
 
 
664 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  35.82 
 
 
641 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  37.61 
 
 
724 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 
683 aa  351  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  37.68 
 
 
724 aa  350  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  37.41 
 
 
721 aa  349  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  37.61 
 
 
724 aa  349  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  37.46 
 
 
641 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  37.97 
 
 
727 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  37.79 
 
 
727 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  37.79 
 
 
727 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  37.79 
 
 
727 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  38.02 
 
 
741 aa  343  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  38.04 
 
 
730 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  37.84 
 
 
680 aa  342  9e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  37.46 
 
 
611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  37.84 
 
 
727 aa  336  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  37.41 
 
 
727 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  37.61 
 
 
727 aa  336  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  37.23 
 
 
727 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  37.23 
 
 
727 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  37.43 
 
 
734 aa  333  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  36.48 
 
 
707 aa  333  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  36.33 
 
 
704 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  36.53 
 
 
703 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  36.6 
 
 
634 aa  329  7e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  38.21 
 
 
719 aa  329  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  36.94 
 
 
634 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  34.9 
 
 
721 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  37.15 
 
 
721 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  35.35 
 
 
676 aa  319  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  34.26 
 
 
720 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  36.8 
 
 
681 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  32.18 
 
 
716 aa  303  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3489  glucosyltransferase MdoH  35.14 
 
 
624 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465641  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  32.85 
 
 
706 aa  293  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2856  glucosyltransferase MdoH  34.55 
 
 
643 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  37.9 
 
 
624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  35.06 
 
 
642 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3082  glucosyltransferase MdoH  34.96 
 
 
643 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1535  glucosyltransferase MdoH  34.34 
 
 
630 aa  280  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217961  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2974  glucosyltransferase MdoH  34.77 
 
 
643 aa  277  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  34.25 
 
 
724 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  34.25 
 
 
724 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3199  glucosyltransferase MdoH  32.8 
 
 
625 aa  263  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>