130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67065 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  64.75 
 
 
847 aa  1049    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  65.1 
 
 
837 aa  1046    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  75.7 
 
 
857 aa  1328    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  58.18 
 
 
862 aa  922    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  75.61 
 
 
859 aa  1321    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  75.76 
 
 
860 aa  1313    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  78.67 
 
 
851 aa  1296    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  56.19 
 
 
861 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  75.7 
 
 
856 aa  1314    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  65.95 
 
 
849 aa  1085    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  58.55 
 
 
832 aa  927    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  56.75 
 
 
823 aa  895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 
861 aa  1752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  57.86 
 
 
860 aa  932    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  66.09 
 
 
866 aa  1055    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  64.65 
 
 
842 aa  1048    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  66.75 
 
 
845 aa  1066    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  67.54 
 
 
854 aa  1094    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  75.7 
 
 
857 aa  1330    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  98.37 
 
 
860 aa  1668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  68.85 
 
 
854 aa  1071    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  64.75 
 
 
847 aa  1049    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  64.95 
 
 
847 aa  1050    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  68.28 
 
 
853 aa  1093    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  67.03 
 
 
849 aa  1080    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  77.21 
 
 
857 aa  1331    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  66.71 
 
 
869 aa  1085    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  64.75 
 
 
847 aa  1049    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  64.98 
 
 
837 aa  1044    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  77.33 
 
 
857 aa  1338    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  65.1 
 
 
837 aa  1046    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  66.2 
 
 
854 aa  1102    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  64.87 
 
 
847 aa  1050    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  59.93 
 
 
852 aa  924    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  64.17 
 
 
847 aa  1052    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  64.17 
 
 
847 aa  1052    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  64.17 
 
 
847 aa  1051    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  64.17 
 
 
847 aa  1051    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  64.17 
 
 
847 aa  1052    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  46.15 
 
 
698 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  44.2 
 
 
715 aa  574  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  46.52 
 
 
671 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  45.95 
 
 
737 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  49.08 
 
 
694 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2784  glucosyltransferase MdoH  47.28 
 
 
660 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  46.05 
 
 
656 aa  545  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  46.45 
 
 
679 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3378  glucosyltransferase MdoH  45.64 
 
 
631 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  43.78 
 
 
713 aa  528  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  42.69 
 
 
692 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  42.69 
 
 
692 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  51 
 
 
717 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2578  glucosyltransferase MdoH  42.15 
 
 
716 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  38.63 
 
 
704 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1668  glucosyltransferase MdoH  39.41 
 
 
701 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  40.66 
 
 
724 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  38.4 
 
 
727 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  38.4 
 
 
727 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  38.4 
 
 
727 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  38.56 
 
 
727 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  40.51 
 
 
724 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  37.65 
 
 
727 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  40.74 
 
 
727 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  40.92 
 
 
727 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  41.92 
 
 
724 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  40.74 
 
 
727 aa  439  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  41.98 
 
 
704 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  41.48 
 
 
730 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  41.08 
 
 
707 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  39.86 
 
 
727 aa  435  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  38.49 
 
 
734 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  39.45 
 
 
703 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  37.46 
 
 
741 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  41.58 
 
 
641 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  40.68 
 
 
721 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  42.73 
 
 
720 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  40.06 
 
 
683 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  38.94 
 
 
719 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  36.62 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  41.54 
 
 
721 aa  416  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  37.7 
 
 
680 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  42.26 
 
 
721 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  40 
 
 
681 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  40.17 
 
 
641 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  40.26 
 
 
611 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  40.78 
 
 
706 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  42.06 
 
 
716 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  37.36 
 
 
634 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  37.05 
 
 
634 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  38.26 
 
 
724 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  38.26 
 
 
724 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  39.36 
 
 
676 aa  357  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  39.49 
 
 
624 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1713  glucosyltransferase MdoH  39.75 
 
 
595 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  38.66 
 
 
642 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2974  glucosyltransferase MdoH  37.77 
 
 
643 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3042  glucosyltransferase MdoH  35.96 
 
 
598 aa  320  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2856  glucosyltransferase MdoH  37.16 
 
 
643 aa  317  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3082  glucosyltransferase MdoH  37.52 
 
 
643 aa  317  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1535  glucosyltransferase MdoH  35.61 
 
 
630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217961  normal  0.15626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>