127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0711 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  50.56 
 
 
727 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  61.84 
 
 
724 aa  829    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  50.42 
 
 
727 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  50.56 
 
 
727 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  48.34 
 
 
730 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  50.56 
 
 
727 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  48.35 
 
 
707 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  61.22 
 
 
704 aa  808    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  49.93 
 
 
727 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 
734 aa  1477    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  49.79 
 
 
727 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  49.79 
 
 
727 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  49.36 
 
 
721 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  49.93 
 
 
727 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  49.93 
 
 
727 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  61.84 
 
 
724 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  59.77 
 
 
719 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  61.3 
 
 
703 aa  819    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  69.96 
 
 
741 aa  998    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  61.96 
 
 
724 aa  820    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  46.49 
 
 
721 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  46.15 
 
 
720 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  45.88 
 
 
721 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  47.85 
 
 
681 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  47.76 
 
 
641 aa  558  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  42.59 
 
 
706 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  41.16 
 
 
716 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  42.31 
 
 
724 aa  508  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  42.31 
 
 
724 aa  508  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  45.23 
 
 
611 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  43.65 
 
 
634 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  43.32 
 
 
634 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  42.93 
 
 
861 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  40.09 
 
 
823 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  39.82 
 
 
715 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  41.69 
 
 
680 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  42.49 
 
 
679 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  39.87 
 
 
862 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  39.2 
 
 
847 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  39.2 
 
 
847 aa  432  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 
837 aa  432  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  39.2 
 
 
837 aa  432  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  39.2 
 
 
847 aa  432  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  39.2 
 
 
847 aa  432  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  39.2 
 
 
837 aa  432  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  39.2 
 
 
847 aa  432  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  40.97 
 
 
860 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  39.59 
 
 
849 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  38.67 
 
 
857 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  38.83 
 
 
857 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  38.84 
 
 
857 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  40.8 
 
 
852 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  38.73 
 
 
847 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  38.73 
 
 
847 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  38.73 
 
 
847 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  38.73 
 
 
847 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  38.73 
 
 
847 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  38.27 
 
 
842 aa  418  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  38.83 
 
 
857 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  38.54 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  38.17 
 
 
854 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  37.8 
 
 
859 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  37.8 
 
 
860 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  38.35 
 
 
698 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  37.54 
 
 
854 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  37.56 
 
 
856 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
683 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  38.34 
 
 
849 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  40.86 
 
 
853 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1535  glucosyltransferase MdoH  41.07 
 
 
630 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217961  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  38.55 
 
 
641 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  38.49 
 
 
861 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  38.33 
 
 
860 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  38.57 
 
 
676 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  41.5 
 
 
851 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  40 
 
 
713 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  40.34 
 
 
866 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  38.24 
 
 
832 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3042  glucosyltransferase MdoH  39.76 
 
 
598 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3489  glucosyltransferase MdoH  40.5 
 
 
624 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465641  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  38.01 
 
 
854 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  38.01 
 
 
869 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  40.99 
 
 
845 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1668  glucosyltransferase MdoH  38.7 
 
 
701 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  38.98 
 
 
737 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3199  glucosyltransferase MdoH  39.42 
 
 
625 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  36.01 
 
 
692 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  36.01 
 
 
692 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  36.72 
 
 
704 aa  357  5e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1713  glucosyltransferase MdoH  37.94 
 
 
595 aa  347  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2578  glucosyltransferase MdoH  39.32 
 
 
716 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  40.44 
 
 
624 aa  337  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  37.91 
 
 
642 aa  336  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  37.94 
 
 
694 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  37.52 
 
 
671 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  38.07 
 
 
656 aa  332  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  37.84 
 
 
717 aa  331  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2856  glucosyltransferase MdoH  41.02 
 
 
643 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3082  glucosyltransferase MdoH  41.43 
 
 
643 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1764  glucosyltransferase MdoH  36.33 
 
 
595 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.834244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>