184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3221 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  68.53 
 
 
720 aa  993    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  58.54 
 
 
681 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 
721 aa  1446    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  48.46 
 
 
724 aa  622  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  48.46 
 
 
724 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  49.72 
 
 
721 aa  617  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  48.65 
 
 
703 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  48.44 
 
 
724 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  45.04 
 
 
741 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  48.22 
 
 
704 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  45.88 
 
 
734 aa  595  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  51.95 
 
 
641 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  43.02 
 
 
727 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  44.15 
 
 
721 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  43.02 
 
 
727 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  43.02 
 
 
727 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  43.18 
 
 
727 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  48 
 
 
719 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  44.11 
 
 
727 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  49.11 
 
 
634 aa  555  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  49.43 
 
 
634 aa  555  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  42.94 
 
 
727 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  42.94 
 
 
727 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  42.73 
 
 
730 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  43.24 
 
 
727 aa  552  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  42.8 
 
 
727 aa  552  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  50.87 
 
 
611 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  42.15 
 
 
707 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  38.71 
 
 
706 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  38.32 
 
 
716 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  43.11 
 
 
676 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  39.35 
 
 
679 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  40.8 
 
 
724 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  40.8 
 
 
724 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  42.07 
 
 
680 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  42.5 
 
 
861 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  39.47 
 
 
823 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  38.22 
 
 
852 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  38.22 
 
 
860 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3489  glucosyltransferase MdoH  42.64 
 
 
624 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465641  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  40.1 
 
 
832 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  38.9 
 
 
715 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  39.73 
 
 
862 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  42.2 
 
 
857 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  41.49 
 
 
698 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
847 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  41.8 
 
 
847 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  41.4 
 
 
837 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
847 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  41.99 
 
 
856 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  41.8 
 
 
847 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  41.8 
 
 
847 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  38.11 
 
 
641 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  41.8 
 
 
847 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  39.66 
 
 
692 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  41.54 
 
 
842 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
837 aa  405  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
847 aa  405  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
847 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  41.8 
 
 
847 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  39.66 
 
 
692 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  42.02 
 
 
857 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
847 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
837 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  41.83 
 
 
857 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  41.8 
 
 
859 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  41.62 
 
 
860 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  41.5 
 
 
857 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  42.09 
 
 
861 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  42.09 
 
 
860 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  43.15 
 
 
853 aa  399  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  42.96 
 
 
854 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  39.91 
 
 
713 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  42.51 
 
 
854 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  41.52 
 
 
849 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  42.78 
 
 
851 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  43.15 
 
 
845 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  42.08 
 
 
683 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  41.34 
 
 
849 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  37.89 
 
 
664 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  42.31 
 
 
866 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  41.99 
 
 
854 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  41.99 
 
 
869 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1535  glucosyltransferase MdoH  37.58 
 
 
630 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217961  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  41.3 
 
 
737 aa  369  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1713  glucosyltransferase MdoH  39.28 
 
 
595 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3042  glucosyltransferase MdoH  39.01 
 
 
598 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1668  glucosyltransferase MdoH  37.84 
 
 
701 aa  353  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3199  glucosyltransferase MdoH  37.32 
 
 
625 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0127  glucosyltransferase MdoH  39.53 
 
 
595 aa  350  7e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.469295  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1764  glucosyltransferase MdoH  39.53 
 
 
595 aa  349  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.834244  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  36.61 
 
 
704 aa  346  8.999999999999999e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  37.76 
 
 
694 aa  342  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  38.64 
 
 
671 aa  337  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2578  glucosyltransferase MdoH  40.46 
 
 
716 aa  336  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  38.87 
 
 
656 aa  335  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2784  glucosyltransferase MdoH  37.22 
 
 
660 aa  328  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3378  glucosyltransferase MdoH  36.04 
 
 
631 aa  327  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  39.53 
 
 
717 aa  324  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  37.79 
 
 
642 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>