31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0324 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  100 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  34.09 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  30.5 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  31.11 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  33.09 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  31.16 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  31.16 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  31.16 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  31.16 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  31.16 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  31.16 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  31.16 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  31.16 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  28.78 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  28.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  28.78 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  28.06 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  28.78 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  28.06 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  28.99 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  25.68 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  30.22 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  29.81 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  25.87 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  32.86 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  28.26 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  24.67 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  27.18 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>