200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0172 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 398 aa  799    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  95.21 
 
 		 398 aa  770    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  31.59 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  29.83 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  28.2 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  32.55 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  29.25 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  27.79 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  29.52 
 
 		 884 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  30.45 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  30.73 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  29.51 
 
 		 399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  29.51 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 387 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.12 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  28.45 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.28 
 
 		 878 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.02 
 
 		 878 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  28.28 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.23 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  31.1 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.95 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  28.45 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.7 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 393 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  27.37 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.91 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.72 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  30.98 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 421 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.03 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  26.68 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.52 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  29.7 
 
 		 397 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.64 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.22 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.29 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  29.23 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  28.3 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.94 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  26.82 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  27.69 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.06 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.83 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.06 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  27.59 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.06 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.06 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  26.63 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.49 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.49 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  28.06 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.48 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  27.14 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.61 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.76 
 
 		 479 aa  126  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  27.38 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.9 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.9 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>