More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2717 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  72.56 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  62.91 
 
 		 285 aa  358  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  65.45 
 
 		 274 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  65.45 
 
 		 274 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  64.47 
 
 		 284 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  64.73 
 
 		 274 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  63.37 
 
 		 277 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  63.14 
 
 		 277 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  62.27 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  61.54 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  60.07 
 
 		 277 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  62.37 
 
 		 280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  61.23 
 
 		 287 aa  335  5.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  60.29 
 
 		 297 aa  328  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  60.07 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  59.71 
 
 		 295 aa  328  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  57.88 
 
 		 287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  56.99 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.18 
 
 		 291 aa  318  7.999999999999999e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  56.99 
 
 		 276 aa  317  9e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  59.27 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  58.8 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  56.57 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  54.04 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  57.91 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  55.47 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.55 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  54.71 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  55.07 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  54.71 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  54.71 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  54.12 
 
 		 304 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  54.71 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  54.01 
 
 		 291 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  54.12 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  54.35 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  53.62 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  54.35 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  54.35 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  53.99 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  50.55 
 
 		 278 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  51.53 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  53.01 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  55.19 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  54.44 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.44 
 
 		 371 aa  258  6e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2146  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.37 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.74 
 
 		 322 aa  257  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.75 
 
 		 342 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1915  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.94 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0882054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.55 
 
 		 342 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  45.59 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.15 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1883  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0757  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0234373  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0012  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.44 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  51.94 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1712  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 		 320 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000540803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  48.89 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.3 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.743742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1695  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.1 
 
 		 322 aa  251  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000898255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2365  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.37 
 
 		 338 aa  251  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.115358  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.3 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4393  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4234  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4246  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4733  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2923  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2451  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.26 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 353 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.57 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0631  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.53 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.575806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.86 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 		 346 aa  248  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  48.13 
 
 		 329 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.56 
 
 		 626 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 		 351 aa  247  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.14 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7027  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.69 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 347 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 347 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.42 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 347 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 347 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 362 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>