43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2181 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  53.64 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  46.18 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  48.34 
 
 		 304 aa  241  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  40.39 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  38.46 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  35.86 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  37.37 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  36.71 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  36.3 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  37.76 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  36.03 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  34.59 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  36.39 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  36.33 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  36.33 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  36.03 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  36.82 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  35.37 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  35.64 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  34.6 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  35.19 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  34.45 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  34.45 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  33.54 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  35.76 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  34.64 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  33.44 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  37.79 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  36.39 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  34.01 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.59 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  37.84 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  37.25 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  37.33 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  31.33 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  30.59 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  32.24 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  31.1 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  25.3 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>