82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0467 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
136 aa  283  7e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5817  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.41 
 
 
137 aa  201  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0574559  normal  0.0623413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.18 
 
 
137 aa  194  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3328  ring-cleaving dioxygenase, putative  61.48 
 
 
137 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.894596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.48 
 
 
137 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4777  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.66 
 
 
137 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.96 
 
 
138 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.93 
 
 
141 aa  181  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.15 
 
 
137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
137 aa  179  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.04 
 
 
163 aa  149  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.46 
 
 
140 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134695  normal  0.0424228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.97 
 
 
145 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.846483  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2602  glyoxalase/bleomycin resistance protein  54.89 
 
 
138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.22 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.17 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  53.73 
 
 
144 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4906  putative dioxygenase/glyoxalase  54.74 
 
 
140 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0018053  hitchhiker  0.00141914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5877  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.73 
 
 
144 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.13 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.45 
 
 
141 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00151992  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.48 
 
 
144 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.27 
 
 
145 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.33 
 
 
146 aa  140  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00588  predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family protein  52.59 
 
 
142 aa  140  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  51.47 
 
 
141 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  55.22 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0355  glyoxalase family protein  54.48 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.62 
 
 
139 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  54.48 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.06 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847153  hitchhiker  0.000129147 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0369  glyoxalase family protein  54.48 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.48 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4066  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.55 
 
 
145 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1342  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.72 
 
 
141 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.0609835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3232  hypothetical protein  49.28 
 
 
141 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.72 
 
 
141 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.72 
 
 
141 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  50.37 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2984  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.99 
 
 
139 aa  134  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
141 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.67 
 
 
141 aa  133  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.99 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2868  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.99 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5652  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.38 
 
 
143 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.15 
 
 
141 aa  130  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0443944  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2670  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.67 
 
 
143 aa  120  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.789603  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38884  predicted protein  44.12 
 
 
191 aa  111  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.81 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00676544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.89 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238299  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.164489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0258  hypothetical protein  32.09 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3557  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.737427  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3556  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3555  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3554  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.336738  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3553  glyoxalase family protein  28.57 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109364  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3552  glyoxalase family protein  27.62 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0360  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4825  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
139 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
141 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29360  glyoxalase, Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  27.54 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  25.76 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0115  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000344124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2248  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384082  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2837  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000107738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0321  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000322119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0114  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000210861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0131  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000275668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2299  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2322  glyoxalase family protein  31.16 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000000100252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0396  lactoylglutathione lyase  32.06 
 
 
138 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2816  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
318 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>