69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4906 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4906  putative dioxygenase/glyoxalase  100 
 
 
140 aa  290  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0018053  hitchhiker  0.00141914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.94 
 
 
144 aa  248  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5877  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.86 
 
 
144 aa  238  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  78.42 
 
 
144 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.12 
 
 
144 aa  223  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.12 
 
 
144 aa  223  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.24 
 
 
146 aa  222  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.29 
 
 
140 aa  221  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  74.1 
 
 
145 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2868  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.64 
 
 
145 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.1 
 
 
145 aa  214  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.91 
 
 
145 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0369  glyoxalase family protein  71.94 
 
 
145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  71.94 
 
 
145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0355  glyoxalase family protein  71.22 
 
 
145 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.84 
 
 
147 aa  203  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.71 
 
 
140 aa  196  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134695  normal  0.0424228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.85 
 
 
145 aa  196  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.846483  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.21 
 
 
147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847153  hitchhiker  0.000129147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2984  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.44 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.18 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.44 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00151992  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2602  glyoxalase/bleomycin resistance protein  64.93 
 
 
138 aa  183  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.58 
 
 
163 aa  183  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3232  hypothetical protein  64.71 
 
 
141 aa  183  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  60.56 
 
 
141 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4066  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.14 
 
 
145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  60.56 
 
 
141 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1342  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.97 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.0609835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.97 
 
 
141 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.97 
 
 
141 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.43 
 
 
139 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
141 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5652  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.04 
 
 
143 aa  170  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.56 
 
 
141 aa  169  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0443944  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.32 
 
 
145 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.71 
 
 
141 aa  166  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00588  predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family protein  58.65 
 
 
142 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2670  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.97 
 
 
143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.789603  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38884  predicted protein  53.33 
 
 
191 aa  147  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.88 
 
 
138 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.74 
 
 
136 aa  144  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4777  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.85 
 
 
137 aa  143  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.11 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.75 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.46 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.47 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5817  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.63 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0574559  normal  0.0623413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.51 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3328  ring-cleaving dioxygenase, putative  48.51 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.894596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.29 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00676544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.29 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238299  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0258  hypothetical protein  36.69 
 
 
146 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.53 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.164489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3556  glyoxalase family protein  34.58 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3553  glyoxalase family protein  34.58 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109364  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3554  glyoxalase family protein  34.58 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.336738  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3555  glyoxalase family protein  34.58 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3557  glyoxalase family protein  34.58 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.737427  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3552  glyoxalase family protein  33.64 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.06 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1771  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  26.87 
 
 
158 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.154627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
166 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3491  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.89 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2248  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.887282  normal  0.86404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>