73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4777 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4777  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
137 aa  284  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  82.96 
 
 
137 aa  240  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  82.22 
 
 
138 aa  235  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.52 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.07 
 
 
137 aa  206  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171085 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5817  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.11 
 
 
137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0574559  normal  0.0623413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.69 
 
 
137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.66 
 
 
136 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3328  ring-cleaving dioxygenase, putative  60.74 
 
 
137 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.894596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.74 
 
 
137 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.26 
 
 
145 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.846483  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.73 
 
 
144 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.73 
 
 
144 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.22 
 
 
147 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.9 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847153  hitchhiker  0.000129147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.38 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2602  glyoxalase/bleomycin resistance protein  52.17 
 
 
138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5877  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.48 
 
 
144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  53.73 
 
 
144 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.52 
 
 
139 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.97 
 
 
140 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.99 
 
 
144 aa  146  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.99 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134695  normal  0.0424228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.07 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00588  predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family protein  51.09 
 
 
142 aa  144  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.79 
 
 
146 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4906  putative dioxygenase/glyoxalase  51.85 
 
 
140 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0018053  hitchhiker  0.00141914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0355  glyoxalase family protein  54.81 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0369  glyoxalase family protein  54.81 
 
 
145 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  54.07 
 
 
145 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  54.81 
 
 
145 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.38 
 
 
163 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.81 
 
 
145 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  53.68 
 
 
141 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  53.68 
 
 
141 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2868  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.24 
 
 
145 aa  140  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2984  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.55 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.38 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3232  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.72 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00151992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.49 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1342  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.8 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.0609835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.17 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.17 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4066  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
145 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2670  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
143 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.789603  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5652  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.56 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.06 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0443944  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38884  predicted protein  43.07 
 
 
191 aa  117  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00676544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
145 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238299  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0258  hypothetical protein  37.31 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.84 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.164489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3555  glyoxalase family protein  33.64 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3557  glyoxalase family protein  33.64 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.737427  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3553  glyoxalase family protein  33.64 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109364  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3554  glyoxalase family protein  33.64 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.336738  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3556  glyoxalase family protein  33.64 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3552  glyoxalase family protein  32.71 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31640  putative ring-cleaving dioxygenase  30.28 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.22 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.22 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2691  putative ring-cleaving dioxygenase  30.28 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2809  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  27.48 
 
 
201 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>