79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0396 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0396  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.93 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742613  hitchhiker  0.00144174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.32 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.100474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.64 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4015  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.47 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.59 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0174  glyoxalase family protein  57.36 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0168  glyoxalase family protein  57.36 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2679  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.58 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3947  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.73 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.991894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1242  hypothetical protein  55.73 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1122  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.33 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0360  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.64 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4248  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.6 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.1 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5258  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.1 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.41 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3295  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.35 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5101  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.69 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 		 145 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.616957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.85 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0131351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3007  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.62 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0308  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.37 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0496645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.29 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07907  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.973583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  33.61 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2367  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.015885 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  30.89 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  32.52 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.56 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  26.47 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  28.99 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933623  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  27.34 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.909465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1199  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 		 287 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0011  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1827  ring-cleaving dioxygenase  29.37 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0866  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.47 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.468879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3172  glyoxalase family protein  31.97 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.139884  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2482  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.5 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204779  normal  0.0473922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3017  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.158959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2195  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.85 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.811141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3236  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.912407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  28.12 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  28.12 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3208  glyoxylase family protein  28.24 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  30.16 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0588  hypothetical protein  25.76 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2983  glyoxylase family protein  27.48 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0071702  normal  0.210559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  29.51 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  33.08 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2976  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  27.69 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2910  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  28.46 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 		 136 aa  40  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 		 159 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 		 146 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458223  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1114  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.22 
 
 		 320 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.118393  normal  0.22369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>