63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3005 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2868  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  99.31 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  91.72 
 
 		 145 aa  275  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  91.03 
 
 		 145 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  91.03 
 
 		 145 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0369  glyoxalase family protein  91.03 
 
 		 145 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0355  glyoxalase family protein  90.34 
 
 		 145 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.48 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4906  putative dioxygenase/glyoxalase  73.91 
 
 		 140 aa  213  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0018053  hitchhiker  0.00141914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5877  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.18 
 
 		 144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  73.72 
 
 		 144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.99 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.99 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.66 
 
 		 146 aa  206  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.23 
 
 		 147 aa  205  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.01 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134695  normal  0.0424228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2602  glyoxalase/bleomycin resistance protein  66.91 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.11 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.846483  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  66.43 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.57 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.57 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00151992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  65 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00588  predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family protein  64.71 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3232  hypothetical protein  62.14 
 
 		 141 aa  183  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4066  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.57 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.03 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847153  hitchhiker  0.000129147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.04 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.43 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.47 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2984  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.76 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.43 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.29 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0443944  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.7 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.7 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1342  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.0609835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5652  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.16 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2670  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.43 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.789603  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38884  predicted protein  52.94 
 
 		 191 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.48 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.48 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.52 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5817  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0574559  normal  0.0623413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4777  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.49 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.63 
 
 		 137 aa  137  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.99 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.86 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.27 
 
 		 137 aa  121  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3328  ring-cleaving dioxygenase, putative  46.27 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.894596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.04 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00676544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.09 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.164489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0258  hypothetical protein  40.48 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3553  glyoxalase family protein  36.63 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3554  glyoxalase family protein  36.63 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.336738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3555  glyoxalase family protein  36.63 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3556  glyoxalase family protein  36.63 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3557  glyoxalase family protein  36.63 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.737427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3552  glyoxalase family protein  35.64 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.81 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.96 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.909574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>