64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5025 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4906  putative dioxygenase/glyoxalase  73.24 
 
 
140 aa  222  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0018053  hitchhiker  0.00141914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.13 
 
 
144 aa  217  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.12 
 
 
147 aa  214  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.63 
 
 
144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.63 
 
 
144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.83 
 
 
145 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.64 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.88 
 
 
140 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134695  normal  0.0424228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2868  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.34 
 
 
145 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  72.39 
 
 
144 aa  207  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5877  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.39 
 
 
144 aa  207  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.66 
 
 
145 aa  206  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  70.15 
 
 
145 aa  200  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0369  glyoxalase family protein  70.15 
 
 
145 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  70.15 
 
 
145 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.36 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.846483  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0355  glyoxalase family protein  69.4 
 
 
145 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2602  glyoxalase/bleomycin resistance protein  67.91 
 
 
138 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  63.5 
 
 
141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.94 
 
 
147 aa  177  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847153  hitchhiker  0.000129147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2984  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.58 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  62.04 
 
 
141 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.43 
 
 
145 aa  174  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3232  hypothetical protein  60.29 
 
 
141 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.29 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00151992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.82 
 
 
141 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00588  predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family protein  57.78 
 
 
142 aa  170  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.56 
 
 
139 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.4 
 
 
163 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4066  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.56 
 
 
145 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.35 
 
 
141 aa  161  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0443944  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5652  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.48 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.88 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.15 
 
 
141 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.15 
 
 
141 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1342  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.15 
 
 
141 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.0609835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.09 
 
 
137 aa  158  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2670  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.61 
 
 
143 aa  155  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.789603  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.9 
 
 
138 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.11 
 
 
141 aa  150  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4777  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.79 
 
 
137 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5817  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.99 
 
 
137 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0574559  normal  0.0623413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.62 
 
 
141 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.33 
 
 
136 aa  140  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38884  predicted protein  48.53 
 
 
191 aa  137  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3328  ring-cleaving dioxygenase, putative  45.52 
 
 
137 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.894596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.52 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.16 
 
 
143 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00676544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.61 
 
 
145 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238299  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.72 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.164489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0258  hypothetical protein  35.07 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3555  glyoxalase family protein  33.03 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3554  glyoxalase family protein  33.03 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.336738  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3553  glyoxalase family protein  33.03 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109364  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3556  glyoxalase family protein  33.03 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3557  glyoxalase family protein  33.03 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.737427  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3552  glyoxalase family protein  32.11 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2248  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.887282  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0872  glyoxalase family protein  26.19 
 
 
132 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 
139 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>