61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3232 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3232  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  294  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  95.74 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00151992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  92.2 
 
 
141 aa  274  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4066  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  86.52 
 
 
145 aa  258  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  85.11 
 
 
141 aa  257  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1342  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  84.4 
 
 
141 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.0609835 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.69 
 
 
141 aa  254  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.69 
 
 
141 aa  254  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  77.3 
 
 
141 aa  234  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  75.18 
 
 
141 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.05 
 
 
141 aa  222  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0443944  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.77 
 
 
141 aa  192  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.29 
 
 
145 aa  187  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.846483  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2868  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.86 
 
 
145 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  62.14 
 
 
145 aa  184  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4906  putative dioxygenase/glyoxalase  64.71 
 
 
140 aa  183  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0018053  hitchhiker  0.00141914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.14 
 
 
145 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.14 
 
 
145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0369  glyoxalase family protein  62.14 
 
 
145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  62.14 
 
 
145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0355  glyoxalase family protein  62.14 
 
 
145 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.29 
 
 
139 aa  179  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
140 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134695  normal  0.0424228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5877  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.15 
 
 
144 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2602  glyoxalase/bleomycin resistance protein  62.32 
 
 
138 aa  176  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.03 
 
 
145 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.29 
 
 
163 aa  176  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.31 
 
 
140 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.85 
 
 
144 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.29 
 
 
146 aa  174  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.27 
 
 
144 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.27 
 
 
144 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  59.71 
 
 
144 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.57 
 
 
147 aa  173  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.62 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847153  hitchhiker  0.000129147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5652  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.48 
 
 
143 aa  170  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2670  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.86 
 
 
143 aa  166  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.789603  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00588  predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family protein  57.97 
 
 
142 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2984  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 
139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38884  predicted protein  51.45 
 
 
191 aa  142  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4777  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.26 
 
 
138 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5817  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
137 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0574559  normal  0.0623413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.28 
 
 
136 aa  135  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.32 
 
 
137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.38 
 
 
137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.81 
 
 
137 aa  130  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.55 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.53 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3328  ring-cleaving dioxygenase, putative  44.53 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.894596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.61 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00676544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238299  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0258  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.164489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3557  glyoxalase family protein  34.26 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.737427  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3556  glyoxalase family protein  34.26 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3555  glyoxalase family protein  34.26 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3554  glyoxalase family protein  34.26 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.336738  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3553  glyoxalase family protein  34.26 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109364  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3552  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>