70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3328 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3328  ring-cleaving dioxygenase, putative  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.894596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  99.27 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5817  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.85 
 
 		 137 aa  210  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0574559  normal  0.0623413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.48 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.24 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4777  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.74 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.58 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.31 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.26 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.31 
 
 		 141 aa  174  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.73 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.846483  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2602  glyoxalase/bleomycin resistance protein  50.72 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.38 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.87 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.12 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.39 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.847153  hitchhiker  0.000129147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.62 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134695  normal  0.0424228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.62 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00588  predicted dioxygenase of extradiol dioxygenase family protein  45.32 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  47.41 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  46.67 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.52 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.63 
 
 		 163 aa  129  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0355  glyoxalase family protein  49.25 
 
 		 145 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.26 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00151992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4906  putative dioxygenase/glyoxalase  48.51 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0018053  hitchhiker  0.00141914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  47.76 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4066  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.99 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0369  glyoxalase family protein  48.51 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  48.51 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.37 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5877  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.87 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  48.87 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.8 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.45 
 
 		 141 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2984  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.12 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3232  hypothetical protein  44.53 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.72 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.72 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1342  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.72 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.0609835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.62 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.62 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.01 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.27 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2670  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.97 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.789603  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2868  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.27 
 
 		 145 aa  120  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.96 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0443944  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.48 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38884  predicted protein  45.59 
 
 		 191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5652  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239133  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.85 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00676544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0258  hypothetical protein  35.07 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3551  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.79 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.164489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3554  glyoxalase family protein  32.38 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.336738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3553  glyoxalase family protein  32.38 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3555  glyoxalase family protein  32.38 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3557  glyoxalase family protein  32.38 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.737427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3556  glyoxalase family protein  32.38 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3552  glyoxalase family protein  31.43 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.909574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.47 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  26.4 
 
 		 130 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.94 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4481  putative lactoylglutathione lyase  26.09 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298655  unclonable  0.00000133457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  27.59 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.53 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.52 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>