25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1800 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  36.33 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  41.55 
 
 		 154 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  39.61 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  36.41 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  39.23 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  36.91 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  34 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  45.35 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  40.74 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  35.66 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  42.45 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  34.15 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000574  hypothetical protein  36 
 
 		 147 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  34.71 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1071  hypothetical protein  37.36 
 
 		 105 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  31.72 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  37.01 
 
 		 160 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  36.96 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0606  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05308  hypothetical protein  36.24 
 
 		 141 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>