More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1743 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  100 
 
 
187 aa  366  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  38.71 
 
 
187 aa  134  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  39.25 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  39.25 
 
 
189 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  36.11 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  41.94 
 
 
199 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  33.51 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  30.48 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  36.23 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  36.23 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  31.49 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  34.81 
 
 
195 aa  89  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  38.71 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  34.27 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  35.95 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  26.63 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  31.15 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  37.04 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  27.42 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  34.59 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  38.1 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  28.85 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  35.77 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  31.35 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.2 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  29.41 
 
 
446 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1753  Chromate transporter  29.63 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  31.43 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  31.67 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  31.62 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  40.26 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  40.26 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  30.88 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  32.31 
 
 
378 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.37 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  30 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  29.44 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  30 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  31.06 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  30 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  30 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  30.83 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.74 
 
 
416 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  30 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  30.08 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  31.58 
 
 
385 aa  68.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  29.41 
 
 
444 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.61 
 
 
395 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  31.75 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  29.44 
 
 
393 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  28.89 
 
 
393 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  25.53 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  29.17 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  29.44 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  26.18 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  27.13 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  30 
 
 
456 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.5 
 
 
428 aa  65.1  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  30 
 
 
454 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3496  Chromate transporter  25.27 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.68 
 
 
453 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  29.23 
 
 
445 aa  64.3  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.78 
 
 
472 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.33 
 
 
387 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.97 
 
 
420 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  29.32 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.6 
 
 
397 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30 
 
 
450 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  30.63 
 
 
158 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.33 
 
 
387 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  28 
 
 
390 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  28.15 
 
 
376 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  31.15 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  31.03 
 
 
396 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  29.12 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  30.71 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.29 
 
 
348 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  27.97 
 
 
376 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  28 
 
 
390 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  28 
 
 
390 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  31.03 
 
 
396 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.41 
 
 
393 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  31.03 
 
 
396 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.03 
 
 
396 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  29.23 
 
 
456 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1752  Chromate transporter  25.74 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  31.03 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  29.84 
 
 
453 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  31.03 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.54 
 
 
472 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  25.41 
 
 
397 aa  62  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.03 
 
 
392 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  26.88 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  31.3 
 
 
418 aa  62  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.51 
 
 
404 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  30.08 
 
 
394 aa  61.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.82 
 
 
441 aa  61.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.46 
 
 
447 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  26.63 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  27.49 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>