More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0947 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  100 
 
 
692 aa  1405    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  42.26 
 
 
696 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  43.09 
 
 
670 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  43.11 
 
 
680 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  42.63 
 
 
691 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.07 
 
 
692 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  40.52 
 
 
694 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  40.99 
 
 
695 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  40.14 
 
 
696 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  41.15 
 
 
688 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  40.46 
 
 
695 aa  534  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  43.32 
 
 
682 aa  529  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  40.64 
 
 
682 aa  514  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  39.11 
 
 
696 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  40.32 
 
 
694 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  40.41 
 
 
679 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  39.28 
 
 
696 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  39.42 
 
 
685 aa  508  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  39.77 
 
 
667 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  39.39 
 
 
673 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  39.53 
 
 
689 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  39.94 
 
 
696 aa  504  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  39.07 
 
 
683 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  39.97 
 
 
691 aa  502  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  39.37 
 
 
697 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  41.3 
 
 
688 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  38.75 
 
 
697 aa  498  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.78 
 
 
683 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  40.59 
 
 
686 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  39.21 
 
 
683 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  39.56 
 
 
692 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  38.81 
 
 
692 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  38.61 
 
 
697 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  39.3 
 
 
686 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  39.62 
 
 
691 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  38.95 
 
 
691 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  38.72 
 
 
673 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  39.88 
 
 
701 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  39.32 
 
 
691 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  38.86 
 
 
697 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  38.92 
 
 
683 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  39.47 
 
 
691 aa  492  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  38.34 
 
 
692 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  38.73 
 
 
701 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  38.39 
 
 
692 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  39.33 
 
 
693 aa  487  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  38.88 
 
 
691 aa  487  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  40.44 
 
 
686 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  39.08 
 
 
695 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  39.94 
 
 
690 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  38.04 
 
 
694 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  38.71 
 
 
701 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  37.76 
 
 
692 aa  484  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.11 
 
 
701 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  37.63 
 
 
685 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  38.86 
 
 
694 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  38.78 
 
 
687 aa  480  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  38.28 
 
 
698 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  38.18 
 
 
690 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  38.62 
 
 
691 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  37.08 
 
 
697 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  38.65 
 
 
703 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  37.63 
 
 
692 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  37.81 
 
 
697 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  38.62 
 
 
691 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  37.76 
 
 
691 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  37.55 
 
 
692 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  37.99 
 
 
698 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  38.46 
 
 
695 aa  479  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  37.12 
 
 
691 aa  475  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  38.12 
 
 
699 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  37.81 
 
 
689 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  38.28 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  37.88 
 
 
701 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  38.28 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  37.5 
 
 
692 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  36.97 
 
 
692 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  36.76 
 
 
689 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  38.51 
 
 
689 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  37.66 
 
 
692 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  37.72 
 
 
691 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  37.99 
 
 
698 aa  475  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  38.28 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  38.45 
 
 
692 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  36.93 
 
 
697 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  37.12 
 
 
692 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  37.74 
 
 
688 aa  475  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  37.89 
 
 
688 aa  475  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  37.85 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  37.85 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  39.24 
 
 
691 aa  475  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  38.28 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  37.57 
 
 
697 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  37.92 
 
 
707 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  37.48 
 
 
692 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  37.57 
 
 
691 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  36.93 
 
 
697 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  37.57 
 
 
691 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  37.7 
 
 
698 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  37.97 
 
 
699 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>