More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0593 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0593  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  282  9e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  184  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  59.29 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  57.25 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  63.85 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  57.45 
 
 		 163 aa  169  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  56.2 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1045  ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  59.71 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  56.2 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  56.2 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  54.35 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  55.07 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  56.52 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  56.2 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 144 aa  166  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  55.07 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  54.74 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  55.07 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  56.52 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  54.35 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  54.74 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  54.35 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  54.01 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  56.52 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  57.25 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  57.25 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  55.07 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  56.2 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  54.68 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  53.62 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  52.55 
 
 		 143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>