45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0417 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  31.64 
 
 
228 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  31.51 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  29 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  25.5 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  27.23 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  26.51 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  26.11 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  30.19 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  27.46 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  25.41 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  24.39 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  24.39 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  26.52 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  28.8 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  26.52 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  27.14 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  25.58 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  27.27 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  26.8 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  30.88 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0310  hypothetical protein  29.48 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  26.67 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  25.13 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  24.19 
 
 
219 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  29.81 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  23.78 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  25.62 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0328  hypothetical protein  28.32 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  27.04 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  23.12 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  23.5 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  30.91 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  24.59 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  23.08 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  25.4 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  25.89 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  24.56 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  25.69 
 
 
228 aa  42  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>