42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12983 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  100 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  67.15 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  66.5 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  66.5 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  64.02 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  68.34 
 
 		 211 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  47.42 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  50.27 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  49.47 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  46.92 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  50.72 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  50 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  44.61 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  49.17 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  43.59 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  46.88 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  46.6 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  45.14 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  46.24 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  39.78 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  45.51 
 
 		 181 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  39.13 
 
 		 241 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  47.01 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  39.67 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  44.35 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  41.43 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  42.21 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  36.02 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  37.5 
 
 		 247 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  35.26 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  35.21 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  35.21 
 
 		 258 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  35.83 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  36 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  35.2 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 		 139 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  31.86 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  32.11 
 
 		 151 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  30.1 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  28.21 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2666  Vitamin K epoxide reductase  28.41 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  30.11 
 
 		 125 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>