More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2082 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  61.75 
 
 		 681 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  62.22 
 
 		 680 aa  808    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  61.23 
 
 		 676 aa  802    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  100 
 
 		 662 aa  1345    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  51.34 
 
 		 671 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  59.02 
 
 		 678 aa  759    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  59.17 
 
 		 678 aa  762    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  58.68 
 
 		 688 aa  797    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  59.79 
 
 		 675 aa  790    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  44.97 
 
 		 669 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  46.95 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  45.4 
 
 		 667 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  46.66 
 
 		 683 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  46.36 
 
 		 683 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  44.87 
 
 		 670 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  44.41 
 
 		 696 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  44.26 
 
 		 699 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  44.64 
 
 		 682 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  45.41 
 
 		 655 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  43.28 
 
 		 678 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  43.48 
 
 		 678 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  44.08 
 
 		 671 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  42.55 
 
 		 686 aa  492  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  41.72 
 
 		 642 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  39.97 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  41 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.53 
 
 		 680 aa  399  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  34.11 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.37 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  35.94 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.31 
 
 		 692 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  33.83 
 
 		 679 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  33.24 
 
 		 697 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  33.24 
 
 		 697 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  31.79 
 
 		 695 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  31.58 
 
 		 688 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.51 
 
 		 682 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.98 
 
 		 670 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.19 
 
 		 694 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  32.2 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.33 
 
 		 682 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  31.57 
 
 		 695 aa  362  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  33.97 
 
 		 691 aa  362  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.07 
 
 		 701 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  34.43 
 
 		 656 aa  360  6e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  33.09 
 
 		 673 aa  359  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  33.33 
 
 		 697 aa  359  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  33.28 
 
 		 683 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  33.82 
 
 		 701 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  33.38 
 
 		 686 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  32.75 
 
 		 691 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  31.98 
 
 		 697 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  34.41 
 
 		 687 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  32.41 
 
 		 695 aa  354  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.14 
 
 		 686 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.39 
 
 		 696 aa  352  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  31.59 
 
 		 701 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  31.93 
 
 		 695 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  32.8 
 
 		 689 aa  352  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  31.24 
 
 		 694 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 690 aa  349  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  33.43 
 
 		 688 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  32.66 
 
 		 707 aa  347  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  31.65 
 
 		 703 aa  347  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  30.36 
 
 		 696 aa  347  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  30.22 
 
 		 696 aa  346  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  30.56 
 
 		 697 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  31.52 
 
 		 692 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  32.89 
 
 		 677 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  31.96 
 
 		 691 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  31.2 
 
 		 692 aa  344  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  32.71 
 
 		 704 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  31.44 
 
 		 697 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  31.82 
 
 		 691 aa  343  5.999999999999999e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  29.81 
 
 		 694 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  31.62 
 
 		 692 aa  341  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  31.4 
 
 		 696 aa  341  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  32.04 
 
 		 703 aa  341  2.9999999999999998e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  31.92 
 
 		 690 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  32.37 
 
 		 695 aa  340  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  33.09 
 
 		 697 aa  340  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  32.83 
 
 		 667 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  33.58 
 
 		 690 aa  339  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  30.76 
 
 		 691 aa  339  9e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  32.6 
 
 		 686 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  31.92 
 
 		 699 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  31.52 
 
 		 696 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  31.41 
 
 		 701 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  31.62 
 
 		 691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  31.32 
 
 		 691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.09 
 
 		 691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  31.58 
 
 		 694 aa  337  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  30.47 
 
 		 682 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  31.46 
 
 		 699 aa  336  7e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  30.26 
 
 		 693 aa  336  7.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  31.57 
 
 		 689 aa  336  9e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  31.94 
 
 		 696 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  32.65 
 
 		 683 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  31.46 
 
 		 699 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  31.7 
 
 		 701 aa  335  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>