283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0530 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  100 
 
 
317 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  61.39 
 
 
306 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  59.8 
 
 
324 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  58.61 
 
 
308 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  60.6 
 
 
311 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  60.6 
 
 
311 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  59.14 
 
 
312 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  55.52 
 
 
323 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  54.43 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  52.92 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  48 
 
 
312 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  48 
 
 
312 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00061  hypothetical protein  49.83 
 
 
324 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00061  hypothetical protein  47.35 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  47.23 
 
 
326 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0007  hypothetical protein  41.94 
 
 
314 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  42.9 
 
 
314 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00061  hypothetical protein  42.86 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00061  hypothetical protein  41.23 
 
 
318 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  42.81 
 
 
308 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.22 
 
 
309 aa  250  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  40.86 
 
 
312 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
397 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  43.75 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  43.75 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  43.32 
 
 
380 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.37 
 
 
388 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  40.86 
 
 
314 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  44.26 
 
 
363 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  44.09 
 
 
362 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  43.51 
 
 
368 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  43.75 
 
 
379 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  44.09 
 
 
362 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
379 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  41.61 
 
 
308 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  44.19 
 
 
357 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  39.27 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  39.53 
 
 
315 aa  238  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  43 
 
 
380 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
379 aa  235  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.91 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  44.37 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
384 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.56 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.28 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.42 
 
 
384 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  41.31 
 
 
438 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  42.81 
 
 
354 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  43.51 
 
 
354 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  42.76 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  43.09 
 
 
379 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  42.76 
 
 
379 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  42.81 
 
 
374 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  41.67 
 
 
373 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  42.43 
 
 
375 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  41.53 
 
 
359 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  42.81 
 
 
369 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  42.76 
 
 
379 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  42.17 
 
 
354 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  41.31 
 
 
373 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 
354 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  40.25 
 
 
398 aa  225  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.72 
 
 
386 aa  225  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  41.53 
 
 
354 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  39.55 
 
 
355 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.51 
 
 
360 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  41.53 
 
 
347 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.13 
 
 
375 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.62 
 
 
380 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  40.26 
 
 
377 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  42.62 
 
 
383 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 
366 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  41.75 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  42.58 
 
 
428 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.27 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  40.07 
 
 
393 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  41.46 
 
 
383 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  40.78 
 
 
385 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  41.04 
 
 
374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.08 
 
 
362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 
357 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  41.96 
 
 
343 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  39.22 
 
 
355 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  41.78 
 
 
348 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  40.07 
 
 
404 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  42.11 
 
 
348 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  40.52 
 
 
372 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.05 
 
 
382 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>