35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3719 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  306  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  61.38 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  57.45 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  53.44 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  53.44 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  54.89 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  52.67 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  52.71 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  48.99 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  49.32 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  47.3 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  46.62 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  45.39 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  45.52 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  38 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  30.82 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  28.89 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  25.55 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  26.03 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  26.03 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  28.35 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  26.19 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  24.84 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  21.01 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  25.35 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3912  hypothetical protein  22.45 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  24.64 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  37.68 
 
 		 168 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>