53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3127 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  71.57 
 
 		 697 aa  1053    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  72.21 
 
 		 695 aa  1076    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  100 
 
 		 698 aa  1437    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  72.21 
 
 		 695 aa  1076    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  78.4 
 
 		 699 aa  1156    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  86.06 
 
 		 703 aa  1275    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  72.21 
 
 		 695 aa  1077    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  67.23 
 
 		 704 aa  948    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  79.97 
 
 		 699 aa  1198    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  72.06 
 
 		 695 aa  1074    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  60.6 
 
 		 693 aa  894    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  72.78 
 
 		 695 aa  1043    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  64.18 
 
 		 695 aa  953    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  72.92 
 
 		 695 aa  1046    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  72.78 
 
 		 695 aa  1043    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  39.86 
 
 		 668 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  40.43 
 
 		 669 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  38.72 
 
 		 711 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  40.57 
 
 		 668 aa  488  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  39.89 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  39.97 
 
 		 668 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  39.52 
 
 		 668 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  38.26 
 
 		 716 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  40.11 
 
 		 674 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  38.26 
 
 		 716 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  38.26 
 
 		 716 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  38.3 
 
 		 669 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  37.97 
 
 		 716 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  37.48 
 
 		 712 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  37.74 
 
 		 703 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  36.74 
 
 		 712 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  37.48 
 
 		 712 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  38.95 
 
 		 672 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  36.92 
 
 		 712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  36.86 
 
 		 662 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  36.86 
 
 		 662 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  35.99 
 
 		 667 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  35.85 
 
 		 667 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  34.99 
 
 		 667 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  34.91 
 
 		 698 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  34.89 
 
 		 669 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  33.8 
 
 		 672 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  27.59 
 
 		 656 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  26.22 
 
 		 660 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  25.9 
 
 		 681 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  26.14 
 
 		 565 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  26.74 
 
 		 573 aa  144  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  22.93 
 
 		 772 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  24 
 
 		 835 aa  120  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.01 
 
 		 807 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  22.67 
 
 		 830 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  21.13 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  22.16 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>