27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2856 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 375 aa  754    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  54.64 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  52.25 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  44.33 
 
 		 412 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  44.27 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  44.27 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  43.12 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  48.59 
 
 		 424 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  42.97 
 
 		 398 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  39.76 
 
 		 449 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  40.74 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  39.85 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  45.73 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  39.71 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  69.37 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  36.25 
 
 		 166 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  36.25 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  31.82 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  38.37 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  34.62 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  35.8 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 536 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  40.24 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  32.05 
 
 		 257 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>