24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2230 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  53.8 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  31.29 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  29.71 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  34.93 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.61 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.17 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1591  hypothetical protein  28.73 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  28.08 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  32.46 
 
 		 703 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  29.51 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  25.32 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  26.63 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3663  hypothetical protein  24.03 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  36.76 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  31.4 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2378  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.590861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  41.82 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1085  hypothetical protein  27.83 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0472517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  25.62 
 
 		 697 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  25.95 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  60 
 
 		 1006 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4394  hypothetical protein  25.45 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.130014  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4378  hypothetical protein  28.29 
 
 		 172 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>