34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1010 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  153  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  53.42 
 
 
74 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  54.41 
 
 
74 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  54.41 
 
 
74 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  52.05 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  49.3 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  42.47 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  42.47 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  38.89 
 
 
73 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  35.62 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  46.67 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  46.38 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  34.25 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  34.25 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  35.62 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  36.99 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  41.1 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  35.62 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  31.51 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  36.76 
 
 
73 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  36.99 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  37.5 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  43.75 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  37.31 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  32.39 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  30.43 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  36 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  39.39 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  33.33 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0211  YcfA family protein  34.25 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  34.85 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  32 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  31.82 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  29.17 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>