More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4937 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.17 
 
 
282 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  33.2 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
360 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
360 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
358 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  30.12 
 
 
361 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.55 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  31.4 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.85 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  32.79 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  30 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
293 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.66 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  25.76 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  31.98 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  26.88 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  28.5 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.65 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  31.94 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  30.6 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
437 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  29.31 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.06 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  31.34 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.88 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0556  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  31.34 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.64 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.46 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.46 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  28.88 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  30.86 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  26.56 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  34.16 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  26.23 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  32.69 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  29.11 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.12 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.94 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  27.71 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  26.5 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.37 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  28.79 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.61 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.32 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  31.52 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  27.31 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.19 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  25 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  30.86 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.6 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  29.53 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  32.16 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.06 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  27.22 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.08 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  25.47 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  29.69 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>