22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4588 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  66.16 
 
 		 199 aa  278  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  55.39 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  59.41 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  56.22 
 
 		 206 aa  220  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  55 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  27.37 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  26.25 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  26.57 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  29.8 
 
 		 467 aa  61.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 596 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  32.06 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  24.68 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 480 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  29.81 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0738  hypothetical protein  32.48 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00463376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1883  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 457 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  25.66 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3142  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 504 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2911  hypothetical protein  23.03 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.603232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 503 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>