28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3934 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  33.7 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  33.97 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  29.45 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  40.26 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  40.26 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1090  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  41.18 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  33.67 
 
 		 472 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  31.69 
 
 		 474 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  38.96 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  32.65 
 
 		 472 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  31.02 
 
 		 467 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  35.24 
 
 		 966 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  36.36 
 
 		 545 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  36.36 
 
 		 342 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  29.21 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  35.8 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  29.79 
 
 		 397 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2050  hypothetical protein  44 
 
 		 93 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  35.9 
 
 		 533 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  34.18 
 
 		 458 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  31.96 
 
 		 990 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 440 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  28.37 
 
 		 498 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  33.71 
 
 		 458 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  40.23 
 
 		 367 aa  42  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>