141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3489 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3489  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 
624 aa  1248    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465641  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  43.41 
 
 
727 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  42.6 
 
 
721 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  43.24 
 
 
727 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  43.24 
 
 
727 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  43.24 
 
 
727 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  40.69 
 
 
676 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  43.41 
 
 
727 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  43.24 
 
 
727 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  42.47 
 
 
730 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  43.24 
 
 
727 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  43.07 
 
 
727 aa  425  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  43.24 
 
 
727 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  42.32 
 
 
720 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  41.89 
 
 
721 aa  422  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  43.13 
 
 
721 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  42.14 
 
 
707 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  41.4 
 
 
641 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  42.62 
 
 
704 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  42.83 
 
 
719 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  43.44 
 
 
703 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  39.6 
 
 
634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  39.1 
 
 
634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  41.03 
 
 
681 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  41.14 
 
 
724 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  41.23 
 
 
724 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  40.97 
 
 
724 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  40.37 
 
 
611 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  40.5 
 
 
734 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  38.3 
 
 
741 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  41.17 
 
 
680 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  36.07 
 
 
716 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  36.6 
 
 
706 aa  362  9e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  38.93 
 
 
715 aa  360  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  38.54 
 
 
724 aa  359  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  38.54 
 
 
724 aa  359  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1535  glucosyltransferase MdoH  40.17 
 
 
630 aa  348  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217961  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  39.44 
 
 
679 aa  343  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  39.77 
 
 
683 aa  340  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  38.78 
 
 
692 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  38.78 
 
 
692 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3042  glucosyltransferase MdoH  39.28 
 
 
598 aa  334  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  37.1 
 
 
823 aa  327  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  37.88 
 
 
861 aa  323  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  36.29 
 
 
671 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  38.48 
 
 
641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  38.52 
 
 
713 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  38.06 
 
 
698 aa  320  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3199  glucosyltransferase MdoH  37.29 
 
 
625 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  35.8 
 
 
852 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  41.54 
 
 
737 aa  318  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  35.8 
 
 
860 aa  318  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1713  glucosyltransferase MdoH  38.2 
 
 
595 aa  316  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  38.16 
 
 
694 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  35.79 
 
 
862 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  35.21 
 
 
664 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
837 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
837 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
837 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2784  glucosyltransferase MdoH  38.16 
 
 
660 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  36.25 
 
 
842 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 
847 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  36.85 
 
 
656 aa  300  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  36.57 
 
 
857 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  36.38 
 
 
857 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3378  glucosyltransferase MdoH  34.33 
 
 
631 aa  299  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1764  glucosyltransferase MdoH  37.45 
 
 
595 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.834244  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0127  glucosyltransferase MdoH  37.26 
 
 
595 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.469295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  36.19 
 
 
857 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  36.01 
 
 
857 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  36.53 
 
 
860 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  36.53 
 
 
859 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  38.9 
 
 
717 aa  294  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  35.15 
 
 
856 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  39.76 
 
 
624 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  34.77 
 
 
853 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  37.36 
 
 
866 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  35.16 
 
 
849 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  35.08 
 
 
832 aa  286  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  35.26 
 
 
849 aa  286  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  36.53 
 
 
642 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  37.4 
 
 
851 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  35 
 
 
854 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  34.35 
 
 
861 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  36.44 
 
 
704 aa  278  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  34.89 
 
 
854 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  34.89 
 
 
869 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  35 
 
 
854 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  36.36 
 
 
845 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  35.06 
 
 
860 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2856  glucosyltransferase MdoH  36.18 
 
 
643 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>