More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3240 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
535 aa  1089    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  61.26 
 
 
468 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  61.46 
 
 
468 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  55.05 
 
 
469 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  56.26 
 
 
463 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  57.45 
 
 
473 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  56.1 
 
 
475 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  51.4 
 
 
467 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  50.97 
 
 
471 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  51.82 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  48.62 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  51.72 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.94 
 
 
470 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
467 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
467 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
467 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 
477 aa  435  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  51.08 
 
 
468 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  53.32 
 
 
469 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  47.74 
 
 
479 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  52.88 
 
 
477 aa  428  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
452 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 
478 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
467 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  47.52 
 
 
472 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  51.67 
 
 
469 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  46.54 
 
 
486 aa  402  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.17 
 
 
469 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  43.47 
 
 
473 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 
484 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  42.61 
 
 
479 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  41.95 
 
 
503 aa  359  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  39.87 
 
 
446 aa  349  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  40.94 
 
 
513 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
512 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
499 aa  329  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
517 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.68 
 
 
488 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  39.21 
 
 
510 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
486 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
486 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
486 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
500 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
500 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
486 aa  323  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
486 aa  323  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
500 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
500 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
486 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
486 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  39.3 
 
 
510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
499 aa  320  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.85 
 
 
476 aa  320  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 
494 aa  320  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
499 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 
500 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
496 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
488 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.74 
 
 
490 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.41 
 
 
490 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
499 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
488 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
499 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
488 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  38.53 
 
 
503 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
499 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  39.37 
 
 
485 aa  315  9e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  38.72 
 
 
499 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  44.1 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  37.24 
 
 
490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  38.23 
 
 
497 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
486 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
488 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.45 
 
 
497 aa  313  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  38.34 
 
 
499 aa  313  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
476 aa  310  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.25 
 
 
480 aa  310  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 
483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.95 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  38.22 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.96 
 
 
496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.81 
 
 
501 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.03 
 
 
498 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  36.82 
 
 
502 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
493 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.18 
 
 
479 aa  303  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
487 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2913  aldehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
506 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.701952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>