More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2563 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1442  50S ribosomal protein L11  84.62 
 
 		 143 aa  248  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0833  50S ribosomal protein L11  80.42 
 
 		 143 aa  237  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 142 aa  219  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 142 aa  213  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 142 aa  212  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4435  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 143 aa  209  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 142 aa  206  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  67.83 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1956  50S ribosomal protein L11  64.58 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  67.13 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  64.63 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2956  50S ribosomal protein L11  63.89 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3844  50S ribosomal protein L11  66.89 
 
 		 149 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4367  50S ribosomal protein L11  65.54 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4479  50S ribosomal protein L11  65.54 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3998  50S ribosomal protein L11  65.54 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.748509  normal  0.915544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 141 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  63.64 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0974  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0169903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0836  50S ribosomal protein L11P  64.79 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00174211  normal  0.0898369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0193  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000186819  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1418  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.816838  normal  0.409457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1320  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  190  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458077  normal  0.354215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0159  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000114645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  65.03 
 
 		 143 aa  190  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  190  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  65.22 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0366  50S ribosomal protein L11  63.51 
 
 		 149 aa  189  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.556831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1343  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0774434  normal  0.0441915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  65.03 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1895  50S ribosomal protein L11  63.95 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00848778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0137  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000238493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1819  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.674274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>