More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1601 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
193 aa  396  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3100  hexapaptide repeat-containing transferase  51.7 
 
 
189 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.568306  normal  0.389321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  43.12 
 
 
173 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  40.13 
 
 
173 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0768  ferripyochelin binding protein (fbp)  43.94 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  37.21 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  41.98 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  41.51 
 
 
173 aa  131  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  39.87 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  41.14 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  40.49 
 
 
175 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  37.82 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.24 
 
 
175 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  38.36 
 
 
173 aa  124  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  42.86 
 
 
180 aa  124  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  41.43 
 
 
154 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  43.94 
 
 
171 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.11 
 
 
181 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.21 
 
 
177 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 
174 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  40.74 
 
 
167 aa  122  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  37.59 
 
 
168 aa  121  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  39.87 
 
 
174 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  41.45 
 
 
174 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  39.62 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  42.38 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1206  carbonic anhydrase  39.49 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.099516  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  40.67 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.4 
 
 
176 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  40.91 
 
 
157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  39.87 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  39.85 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
173 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  38.93 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  39.02 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  40.13 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  41.56 
 
 
174 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  37.21 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  37.04 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.39 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  40.27 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  38.61 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  38.75 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  38.26 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  37.14 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  38.67 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  38.67 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  37.5 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  38.67 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  35.62 
 
 
167 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  40.79 
 
 
174 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  44.63 
 
 
160 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  37.18 
 
 
175 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  40.56 
 
 
185 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  40.13 
 
 
174 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  34.04 
 
 
173 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  40.15 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  35.8 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  39.16 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  38.26 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2239  hexapaptide repeat-containing transferase  39.58 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159097  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  37.97 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.46 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  36.48 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06060  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  35.67 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1427  carbonic anhydrase  36.71 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  36.48 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  36.75 
 
 
171 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  34.91 
 
 
178 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  36.75 
 
 
175 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  36.75 
 
 
175 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  36.42 
 
 
174 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  38.82 
 
 
174 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1347  ferripyochelin binding protein  33.54 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  35.26 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 
174 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.58 
 
 
174 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  40.6 
 
 
175 aa  111  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  38.82 
 
 
174 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  38.06 
 
 
174 aa  110  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  37.41 
 
 
177 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  37.04 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  38.06 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  33.71 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1343  ferripyochelin binding protein (fbp)  39.85 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000136354  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  37.42 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2539  hexapaptide repeat-containing transferase  38.93 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  36.69 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  39.85 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  38.06 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  34.25 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  36.31 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  38.12 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  36.9 
 
 
177 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 
175 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  34.84 
 
 
176 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 
174 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  35.09 
 
 
174 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  36.31 
 
 
175 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>