23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0685 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  360  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  40.12 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  35.56 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  44.59 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  34.76 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  43.42 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  40.11 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  40.26 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  35.85 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  40.13 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  31.46 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  34.44 
 
 		 175 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  33.93 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  33.89 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  36.6 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  36.08 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  45.65 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  45.65 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  46.25 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  45.65 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  27.63 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>