More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_37410  glycosyl transferase  100 
 
 
324 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0782331  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
243 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0236  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
308 aa  126  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.855087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  29.31 
 
 
312 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  32.58 
 
 
312 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
320 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
312 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
240 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0299  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
342 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.41 
 
 
240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
319 aa  112  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
312 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  36.63 
 
 
237 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
337 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
319 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
325 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
324 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
336 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
312 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
323 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.16 
 
 
237 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
334 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
324 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  29.61 
 
 
337 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
383 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
310 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
319 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
337 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3414  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
306 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  29.97 
 
 
332 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
331 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  28.98 
 
 
346 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
314 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  30.85 
 
 
348 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
327 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  29.71 
 
 
350 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
312 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
314 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
318 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2999  b-glycosyltransferase  30.32 
 
 
310 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.221731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  27.57 
 
 
308 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
568 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
387 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
340 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 
242 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
311 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
320 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
311 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
312 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  27.35 
 
 
310 aa  102  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.31 
 
 
319 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.33 
 
 
323 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  32.73 
 
 
324 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 
335 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
343 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 
347 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0744  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
327 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  28.47 
 
 
308 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0728  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
327 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
312 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
324 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1606  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
324 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
339 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.71 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
312 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  25.71 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
347 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  28.47 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.09 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  27.96 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.09 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.09 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.09 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
318 aa  99.4  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
320 aa  99  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
327 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.09 
 
 
327 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 
320 aa  99  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0363  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.43 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
308 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
337 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
312 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  34.7 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  29.63 
 
 
367 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  28.11 
 
 
310 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  29.27 
 
 
237 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>