68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  100 
 
 		 87 aa  176  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  71.05 
 
 		 78 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1011  glutaredoxin 2  55 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  56 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  53.33 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0668  glutaredoxin 2  51.81 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.92813  normal  0.901125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0688  glutaredoxin 2  51.81 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.221037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0675  glutaredoxin 2  51.81 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  55.56 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  51.28 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  54.79 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  43.37 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  50 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  50 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  48.68 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  50 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  50 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  45.78 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  42.31 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  41.56 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  38.67 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  42.47 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  41.1 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  47.44 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0068  glutaredoxin 2  50 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0187457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4374  glutaredoxin 2  40.91 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  39.29 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  40.51 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  37.18 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18000  glutaredoxin 2  36.71 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  39.02 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  40.45 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  34.21 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  29.33 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  38.67 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  32.05 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  37.7 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  31.08 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  38.81 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  38.33 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  38.81 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  38.81 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  35.82 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  28.95 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  37.31 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  37.31 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  29.87 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  41.51 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  42.11 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  26.76 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  32.31 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  34.85 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  34.85 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  34.85 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  35.82 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  34.85 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  34.85 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  34.85 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  34.85 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  38.81 
 
 		 80 aa  42  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  40 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>