63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1996 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  44.79 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  34.04 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  34.27 
 
 		 259 aa  89  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  33.71 
 
 		 259 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  28.95 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1395  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.483754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  27.46 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  28.5 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  26.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  26.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  26.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  26.94 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  27.37 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  25.62 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  27.55 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  27.55 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  27.55 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  27.55 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  27.55 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  28.95 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  26.86 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  26.85 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  27.6 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  27.08 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  27.95 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  28 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  26 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1531  putative lipoprotein  24.69 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.009595  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  28 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  27.08 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  26.56 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  27.08 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  27.08 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  24 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  24.53 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  28.25 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  26.4 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  24.06 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  26.85 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  23.73 
 
 		 195 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  22.67 
 
 		 181 aa  42  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  25.97 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  21.51 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>