34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0794 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  791    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  33.17 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  33.25 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  31.41 
 
 
410 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  30.2 
 
 
396 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  31.4 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  28.92 
 
 
393 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  28.76 
 
 
386 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  29.14 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  27.3 
 
 
428 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  26.02 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  24.42 
 
 
455 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  25.59 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  26.68 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  24.06 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  23.76 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  23.76 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  27.68 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  25.2 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  24.09 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  24.44 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  28.72 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  25.9 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  24.6 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  23.93 
 
 
438 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  23.93 
 
 
456 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  23.08 
 
 
466 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  23.69 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  24.23 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  23.89 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  24.23 
 
 
466 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  24.23 
 
 
466 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  24.23 
 
 
466 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  21.5 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>