182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3680 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3680  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 
105 aa  214  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4057  CutA1 divalent ion tolerance protein  78.3 
 
 
106 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306386  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  48 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00920  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  48.51 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  48.28 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.47 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.43 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.59 
 
 
108 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.59 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2844  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.72 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.59 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3521  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.72 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.59 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.59 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  40.59 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  40.59 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.59 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  39.05 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.57 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  41.75 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.24 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0333  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241952  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0432895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.86 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.38 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.38 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.56 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.57 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  33.65 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  34.62 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.37 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  34.62 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  34.62 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  34.62 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  34.62 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  36.63 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0108  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.43 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000262572 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.69 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.31 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.52 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.55 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.62 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.85 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  32 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0277  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.11 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.29 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0244  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.84 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00963425  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2717  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.66 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.583537  normal  0.620046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  34 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  33.33 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.68 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  32.35 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  32.35 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.67 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.68 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.62 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  32.35 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  34.69 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  34.69 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  34.69 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.91 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.58 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0318  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.45 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.344842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.46 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0355  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.47 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.54 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.68 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.69 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  30 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.59 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0295  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.16 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  34.74 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.51 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2019  hypothetical protein  36.04 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.85 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2619  putative divalent-cation tolerance protein  37.93 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0176718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.26 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>