286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2922 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2922  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
306 aa  600  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  83.93 
 
 
281 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  64.39 
 
 
278 aa  351  8e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1315  phenazine biosynthesis protein PhzF family  67.74 
 
 
280 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2519  phenazine biosynthesis protein PhzF family  63.7 
 
 
283 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.21 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.71 
 
 
301 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.28 
 
 
305 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.84 
 
 
314 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0549  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.58 
 
 
275 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2885  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.26 
 
 
309 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0846454  normal  0.375181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3588  phenazine biosynthesis family protein  45.68 
 
 
277 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0126  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.75 
 
 
276 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0113  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.03 
 
 
276 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.32 
 
 
277 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000932469  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0838  putative phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.45 
 
 
259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.15 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.34 
 
 
299 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.63 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  30.88 
 
 
297 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.14 
 
 
299 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  30.53 
 
 
297 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.58 
 
 
302 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  30.53 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  29.82 
 
 
297 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.18 
 
 
297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  30.18 
 
 
297 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  31.25 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.85 
 
 
299 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.85 
 
 
299 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.16 
 
 
299 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.85 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.32 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.9 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  31.42 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.16 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.8 
 
 
299 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.45 
 
 
299 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  32.12 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.06 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.77 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.63 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.6 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.78 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.6 
 
 
299 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.24 
 
 
301 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  30.47 
 
 
305 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.7 
 
 
278 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.14 
 
 
278 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.91 
 
 
315 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.35 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.27 
 
 
285 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.75 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.75 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.66 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.88 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.08 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.08 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.16 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.62 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.99 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.96 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.79 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.08 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.06 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  33.04 
 
 
265 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.91 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.78 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.06 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.43 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.43 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.78 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  33.21 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.7 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.02 
 
 
268 aa  89  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.49 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  32.67 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  34.4 
 
 
298 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  32.67 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.1 
 
 
306 aa  87  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.41 
 
 
287 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.18 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.48 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.33 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1975  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.03 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.62 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  32.27 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  32.27 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.88 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  34.24 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.74 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.08 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.74 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.24 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.24 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.24 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>