36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3000 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.55 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  28.79 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  28.03 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  29.55 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  25.2 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  32.29 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  24.41 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  32.29 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  30.95 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  26.36 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  30.68 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  23.85 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  25.98 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  25.71 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  25.98 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  33.7 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  27.18 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  25.53 
 
 		 164 aa  48.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  25.53 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  25.84 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  26.32 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  28.09 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 297 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  24.73 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  24.53 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  22.96 
 
 		 173 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  23.94 
 
 		 196 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  29.2 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  25.23 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  29.27 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  29.03 
 
 		 221 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>