28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2746 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2746  ATPase  100 
 
 
387 aa  778    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  28.33 
 
 
361 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  28.37 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  31.22 
 
 
356 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  30.06 
 
 
356 aa  143  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  29.7 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  30.66 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  26.83 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  28.31 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  27.1 
 
 
383 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  29.64 
 
 
360 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  28.83 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  31.36 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  22.28 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  28.21 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  26.28 
 
 
368 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  26.04 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  27.57 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  25.4 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1647  regulatory protein, ArsR  21.89 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  21.23 
 
 
463 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0916  ArsR family transcriptional regulator  21.64 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1030  regulatory protein ArsR  21.39 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.131336  hitchhiker  0.00297317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  27.87 
 
 
462 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  20.82 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1030  regulatory protein ArsR  21.64 
 
 
408 aa  43.5  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.233858  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  28.71 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  28.71 
 
 
456 aa  42.7  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>