27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4507 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  534  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  69 
 
 		 251 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  61.26 
 
 		 260 aa  315  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  66.97 
 
 		 221 aa  307  9e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  68.64 
 
 		 277 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  66.67 
 
 		 272 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  65.75 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  64.41 
 
 		 272 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  64.76 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  58.78 
 
 		 236 aa  288  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  54.55 
 
 		 305 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  54.15 
 
 		 305 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  54.15 
 
 		 272 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  54.55 
 
 		 323 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  59.09 
 
 		 223 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  57.85 
 
 		 213 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  50.21 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  39.71 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  38.35 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  27.7 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  25.89 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  28.23 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  27.48 
 
 		 524 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  27.27 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  24.77 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  23.37 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>