40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3175 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  71.19 
 
 		 123 aa  185  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  68.6 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  66.13 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  66.13 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  64.8 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  64.8 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  68.64 
 
 		 120 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  63.41 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  63.41 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  63.41 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  62.6 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  62.39 
 
 		 123 aa  159  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  55.65 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  53.04 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  47.11 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  49 
 
 		 122 aa  97.1  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  46.99 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  41.38 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  44.83 
 
 		 128 aa  91.3  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  37.39 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  41.96 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  36.75 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  41.38 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  43.68 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  44.58 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  44.58 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  44.58 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  44.58 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  43.68 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  43.68 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  34.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  38.39 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  34.55 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  35.71 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  37.84 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  40.48 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  34.82 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  27.19 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>