More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3162 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  90.94 
 
 		 265 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  90.19 
 
 		 265 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  84.91 
 
 		 265 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  84.15 
 
 		 278 aa  484  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  84.53 
 
 		 265 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  84.53 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  84.53 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  84.53 
 
 		 265 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  84.15 
 
 		 266 aa  477  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  85.34 
 
 		 266 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  84.21 
 
 		 278 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  83.08 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  83.08 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  83.08 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  83.08 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  67.38 
 
 		 280 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  68.05 
 
 		 262 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  65.7 
 
 		 275 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03238  methionine aminopeptidase  60.82 
 
 		 292 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002745  methionine aminopeptidase  59.79 
 
 		 292 aa  361  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0499689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  61.05 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  61.48 
 
 		 264 aa  328  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  59.26 
 
 		 263 aa  321  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  58.85 
 
 		 270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  58.85 
 
 		 258 aa  308  9e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  55.22 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  55.22 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  55.6 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  58.17 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  57.58 
 
 		 261 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  57.41 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  57.53 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  57.53 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  57.41 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  54.48 
 
 		 264 aa  301  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  52.99 
 
 		 264 aa  301  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  54.48 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  54.85 
 
 		 264 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  55.68 
 
 		 261 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  57.31 
 
 		 260 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  56.27 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  56.65 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  54.85 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  57.69 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  54.48 
 
 		 264 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  52.24 
 
 		 264 aa  295  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  54.96 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  54.72 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  56.49 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  54.17 
 
 		 260 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  53.79 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  53.79 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  53.79 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  54.72 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  53.44 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  52.69 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  54.09 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  53.46 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  54.09 
 
 		 266 aa  278  5e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  51.72 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  50.97 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  53.54 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  53.46 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  53.46 
 
 		 264 aa  275  8e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  52.87 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  53.31 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  50.38 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  52.08 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  53.7 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 		 255 aa  272  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  52.92 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  49.43 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  54.8 
 
 		 285 aa  270  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  53.15 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  52.36 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  52.36 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  52.69 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  51.17 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  51.17 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.38 
 
 		 270 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  51.92 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  52.17 
 
 		 268 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  52.17 
 
 		 268 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  51.79 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  51.78 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>