53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1529 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  55.32 
 
 		 712 aa  806    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  54.83 
 
 		 716 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  55.26 
 
 		 716 aa  816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  55.11 
 
 		 716 aa  813    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  56.14 
 
 		 712 aa  824    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  55.54 
 
 		 716 aa  818    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  55.44 
 
 		 712 aa  815    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 711 aa  1460    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  56 
 
 		 712 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  64.7 
 
 		 706 aa  936    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  58.2 
 
 		 703 aa  844    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  45.52 
 
 		 698 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  38.7 
 
 		 703 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  39.77 
 
 		 699 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  38.49 
 
 		 699 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  38.14 
 
 		 695 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  38.72 
 
 		 698 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  38.14 
 
 		 695 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  38.29 
 
 		 695 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  38.29 
 
 		 695 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  36.89 
 
 		 695 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  38.03 
 
 		 697 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  38.03 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  38.18 
 
 		 695 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  37.89 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  36.38 
 
 		 693 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  35.73 
 
 		 704 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  32.09 
 
 		 668 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  31.38 
 
 		 668 aa  331  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  31.19 
 
 		 672 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  29.91 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  29.52 
 
 		 668 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  30.19 
 
 		 662 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  29.76 
 
 		 662 aa  296  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  29.79 
 
 		 668 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  31.28 
 
 		 674 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  29.62 
 
 		 669 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  28.96 
 
 		 667 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  28.82 
 
 		 667 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  28.82 
 
 		 667 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  28.43 
 
 		 672 aa  250  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  28.73 
 
 		 669 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  26.62 
 
 		 660 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  23.25 
 
 		 656 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  24.68 
 
 		 565 aa  127  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  22.37 
 
 		 681 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  23.57 
 
 		 573 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  22.39 
 
 		 706 aa  99.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.88 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.16 
 
 		 835 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  21.37 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  22.2 
 
 		 830 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  22.45 
 
 		 810 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>