53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1306 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  100 
 
 		 672 aa  1371    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  38.98 
 
 		 668 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  38.9 
 
 		 669 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  36.83 
 
 		 669 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  37.61 
 
 		 668 aa  426  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  36.97 
 
 		 668 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  36.91 
 
 		 667 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  37.91 
 
 		 662 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  36.91 
 
 		 667 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  37.65 
 
 		 662 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  36.73 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  37.57 
 
 		 668 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  36.35 
 
 		 674 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  36.38 
 
 		 672 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  33.94 
 
 		 699 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  32.54 
 
 		 703 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  34.18 
 
 		 697 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  33.8 
 
 		 695 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  33.95 
 
 		 695 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  33.8 
 
 		 695 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  33.15 
 
 		 699 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  33.24 
 
 		 698 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  33.19 
 
 		 669 aa  361  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  32.86 
 
 		 695 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  32.86 
 
 		 695 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  32.72 
 
 		 695 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  32.77 
 
 		 695 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  33.05 
 
 		 693 aa  355  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  30.47 
 
 		 695 aa  351  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  32.08 
 
 		 704 aa  331  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  29.45 
 
 		 706 aa  290  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  28.43 
 
 		 711 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  28.17 
 
 		 712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  28.03 
 
 		 712 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  27.75 
 
 		 716 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  27.69 
 
 		 716 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  27.99 
 
 		 716 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  27.75 
 
 		 712 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  27.41 
 
 		 716 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  27.3 
 
 		 712 aa  243  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  27.67 
 
 		 703 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  28.04 
 
 		 698 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  26.46 
 
 		 656 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  26.59 
 
 		 573 aa  173  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  25.07 
 
 		 565 aa  170  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.9 
 
 		 660 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  21.76 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  23.76 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  21.86 
 
 		 772 aa  64.3  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.61 
 
 		 807 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  24.38 
 
 		 830 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  23.57 
 
 		 810 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  19.35 
 
 		 835 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>